Naast de reguliere ambulante en klinische pro Justitia-onderzoeken, bemiddelt het NIFP ook een aantal bijzondere onderzoeken. Deze worden verricht door pro Justitia-rapporteurs die hiervoor specialistische kennis en vaardigheden hebben opgedaan.
Voorbeelden van deze speciale onderzoeken zijn:
De IND gebruikt de resultaten van deze onderzoeken bij beslissingen over asielaanvragen.
- Onderzoek naar verdachten van extremisme en terrorisme: in deze onderzoeken gaat het om de kans dat iemand opnieuw extremistisch geweld pleegt. De rapporteur gebruikt een apart analyse-instrument. Dit instrument heet de VERA-2R.
- Gratiëringsonderzoek: hier wordt de kans op herhaling onderzocht bij een verzoek om gratie. Gratie betekent kwijtschelding van een straf.
- Rapportage over levenslang gestraften: deze rapportage wordt gemaakt als iemand niet meer in beroep kan tegen een levenslange straf. De rapporteur onderzoekt of iemand een psychische stoornis heeft en hoe groot de kans op herhaling van het strafbare feit is. Ook geeft de rapporteur een advies over de behandeling die nodig is.